The pig genome is mapped
In a major international study, the pig genome is now mapped. Researchers from Uppsala University and the Swedish University of Agricultural Sciences (SLU) have contributed to the study by analysing genes that played a key role in the evolution of the domesticated pig and by mapping endogenous retroviruses (ERV), retroviruses whose genes have become part of the host organism’s genome. The findings are now being published in the journals Nature and PNAS.
Together with an international team of geneticists and retrovirologists, Uppsala University researchers have charted the pig genome.
“The pig is one of our most important domesticated animals, and it was high time for its genome to be mapped,” says Professor Leif Andersson, who participated in the project.
The major project to chart the pig genome shows that the wild boar originated in Southeast Asia about 4 million years ago. The findings also reveal that domestication started nearly 10,000 years ago, taking place in several independent locations all over the European and Asian land mass. It was also common that wild boar mixed with domesticated pigs, especially in Europe during early agriculturalisation, with free-ranging animals.
Uppsala researchers Patric Jern, Alexander Hayward, Göran Sperber, and Jonas Blomberg used the computer program RetroTector and detailed sequence comparisons in so-called phylogenetic studies to map the retrovirus part of the pig genome. What all retroviruses, such as HIV in humans, have in common is that they need to become part of the host cell’s genome in order to produce new viruses.
When a germ line-cell is infected there is a chance for the virus to be passed on to the host organism’s offspring, and for millions of years retroviruses remotely related to HIV have colonised vertebrates, leaving traces in their genetic make-up as endogenous retroviruses (ERV).
The researchers were able to see that pigs have fewer ERVs than humans, however, unlike human ERVs, some pig ERVs have the capacity to reproduce and infect, which might pose a risk when transplanting pig organs to humans. The article constitutes a baseline for assessing that risk, but it also provides an enhanced understanding of how retroviruses have spread among vertebrates in the course of their evolution.
Carl-Johan Rubin, Leif Andersson, and their associates have been in charge of looking for the genes that have had the greatest importance in the evolution of the domesticated pig. One of the most striking differences between the wild boar and the domesticated pig is that the latter has a considerably longer back, including more vertebrae.
The researchers have now identified three gene regions that are critical for understanding this difference. Two of them correspond to genes that explain variation in body length in humans, another instance of genes having a very similar function across different species.
Domesticated animals constitute excellent models for evolution, and the new study shows how white colour developed. The gene variant for white colour in pigs differs from the gene variant found in wild boar, with at least five different mutations, four of which are duplications of DNA sequences.
This is the most striking example of two key discoveries the Uppsala scientists have made in recent years, that:
- structural changes in the genome (e.g. duplications) have contributed significantly to the evolution of domesticated animals.
- the evolution of domesticated animals has been underway for so long that we can now see the evolution of gene variants, that is, genes in which several successive mutations gradually changed the function of the gene.
The findings are now being published in Nature and PNAS:
Groenen et al. (2012) Pig genomes provide insight into porcine demography and evolution, Nature, DOI: 10.1038/nature11622
Rubin et al. (2012) Strong signatures of selection in the domestic pig genome. Proceedings of the National Academy of Sciences (USA), DOI: 10.1073/pnas.1217149109
Weitere Meldungen
Neuigkeiten aus der Wissenschaft
Drei Jahre 1st Day Skills Academy
Wie eine Idee die Aus- und Weiterbildung in der Kleintiermedizin revolutioniert hat
JUST4VETS: 248 Gramm Katzenmedizin
Die frisch gedruckte 22. Ausgabe des Tierarztmagazins KATZENMEDIZIN liefert satte 248 g praxisnahe Fachartikel und Praxisfälle, Tierklinik-Reportage, Interviews, aktuelle Praxis- und Einkaufstipps und jede Menge spannende Fortbildungstermine
BTV-Verdachtsfall in Slowenien
Die Generaldirektorin der Behörde für Lebensmittelsicherheit, Veterinärwesen und Pflanzenschutz (UVHVVR), Vida Znoj, stellte am 6. Februar 2025 die neuesten Informationen zur Blauzungenkrankheit (BTV) in Slowenien vor
Erstmals stark gefährdete Taubwarane im Tiergarten Schönbrunn zu sehen
Passend zum "Reverse the Red Day" können die Besucherinnen und Besucher des Tiergarten Schönbrunn eine besondere Premiere erleben
Seeadler: Österreichs Wappentier geht gestärkt in die neue Brutsaison
Gute Nachrichten zum Start der Seeadler-Brutsaison: Neuesten Schätzungen zufolge leben bereits rund 90 Seeadler-Paare mit eigenem Revier in Österreich.
Gewinnspiel: „CAVALLUNA – Grand Moments“: Eine Reise durch schillernde Showwelten
Von Oktober 2024 bis Juni 2025 tourt "CAVALLUNA - Grand Moments " durch 33 Städte in Europa. Wir freuen uns, unter all unseren Newsletter-Abonnenten 3 x 2 Tickets für eine Abendshow in einer Stadt eurer Wahl zu verlosen!
Alpenzoo Innsbruck: Team der Zooschule nun Mitglied der International Zoo Educators Association (IZE)
Die IZE ist ein weltweites Netzwerk von Fachleuten aus Zoos und Aquarien, das sich für innovative Bildungsprogramme und Umweltbewusstsein einsetzt
Stunde der Wintervögel 2025
BirdLife Österreich ruft vom 4. bis 6. Jänner 2025 zur 16. Stunde der Wintervögel, der größten Mitmachaktion des Landes, auf
Futterspende erreicht Zoo Kiew rechtzeitig vor Weihnachten
Pünktlich vor Weihnachten ist eine dringend benötigte Futterspende im Zoo Kiew angekommen
Teile diesen Bericht auf:
Buchtipps Buchtipps Buchtipps

Die Rückkehr der großen Pflanzenfresser
(07. Feb 2025) Konfliktfeld oder Chance für den Artenschutz? - herausgegeben…Fruchtbare Kühe - Gesunde Kälber
(31. Jan 2025) Management und Fütterung als Basis der leistungsbereiten Milchviehherde…Die Bremer Stadtmusikanten: Neues aus der…
(21. Jan 2025) Das Märchen "Die Bremer Stadtmusikanten" ist sicher eins…Zytologie der Haut und Unterhaut
(16. Jan 2025) Das Standardwerk von Francesco Cian und Paola Monti…How and When to Involve Crowds…
(08. Jan 2025) Neues Open-Access-Buch bietet Anleitung für Crowdsourcing in der…Grundlagen moderner Antibiotikatherapie in der Kleintierpraxis
(03. Jan 2025) Das gut strukturierte Nachschlagewerk Grundlagen moderner Antibiotikatherapie in…Internationale Veranstaltungen Int. Veranstaltungen Internationale Veranstaltungen

Webinar zum World Veterinary Dermatology Day…
(13. Jan 2025) Die World Association for Veterinary Dermatology lädt am…Hill's Global Symposium 2024
(20. Okt 2024) Hosted by Hill's Pet Nutrition on Oct. 24-25…7. Kroatischer Veterinärkongress 2024
(22. Jul 2024) Der diesjährige Kroatische Veterinärkongress wird vom 24. bis…EERVC 2024 in Belgrad
(21. Jul 2024) Die Eastern European Regional Veterinary Conference (EERVC) findet…29. FECAVA EuroCongress in Athen
(11. Jul 2024) Die FECAVA lädt vom 12. bis 14. September…2.700 Veterinärmediziner auf dem Weltkongress rund…
(11. Jun 2024) Veterinärmediziner aus 65 Ländern versammelten sich vom 4…Preise und Stipendien Preise und Stipendien Preise und Stipendien
